Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rd3lB2RV38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms