Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Abcc8B2RUS7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc8B2RUS7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms