Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf3B2RUQ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf3B2RUQ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms