Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms