Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CK137956B1AYM9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CK137956B1AYM9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms