Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd5B1AYB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms