Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms