Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2uB1AUC4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2uB1AUC4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms