Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trabd2bB1ATG9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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