Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm438B1ASB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms