Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint7A7XV04 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint7A7XV04 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms