Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skint5A7XUY5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skint5A7XUY5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms