Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms