Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fibcd1A2AV25 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fibcd1A2AV25 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms