Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl41A2AUC9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl41A2AUC9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms