Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms