Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GabreA2AMW3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GabreA2AMW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms