Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel3A2AHA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel3A2AHA7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms