Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom3A2ABU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myom3A2ABU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms