Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87977A2A958 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87977A2A958 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87977A2A958 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87977A2A958 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms