Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Pramef6A2A8M8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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