Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calcoco2A2A6M5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calcoco2A2A6M5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calcoco2A2A6M5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms