Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smurf2A2A5Z6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smurf2A2A5Z6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms