Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav12-2A0N8N6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trav12-2A0N8N6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav12-2A0N8N6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms