Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms