Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RNP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms