Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm6964-201ENSMUST00000117206 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm17748-201ENSMUST00000177906 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm6333-201ENSMUST00000218775 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mindy4b-ps-202ENSMUST00000191233 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm43756-201ENSMUST00000199788 2838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm28321-201ENSMUST00000187677 2327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm11635-202ENSMUST00000139424 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Itpa-ps2-201ENSMUST00000188629 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Olfr523-201ENSMUST00000055890 1056 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ang-201ENSMUST00000069011 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Krtap10-4-201ENSMUST00000092369 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ablim1-206ENSMUST00000111528 2481 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm25679-201ENSMUST00000101973 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm22634-201ENSMUST00000177653 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm26444-201ENSMUST00000178333 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm22317-201ENSMUST00000178469 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm24305-201ENSMUST00000179155 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm22513-201ENSMUST00000179621 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm23804-201ENSMUST00000179675 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm34776-201ENSMUST00000219415 1140 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 AC138667.1-201ENSMUST00000225472 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm22068-201ENSMUST00000082761 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rnu1a1-201ENSMUST00000093684 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Tomm40l-202ENSMUST00000111326 2753 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Utp6-202ENSMUST00000108241 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 I830134H01Rik-202ENSMUST00000181592 2755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Atp2c1-216ENSMUST00000177074 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mitf-207ENSMUST00000203884 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms