Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Adtrp-201ENSMUST00000072012 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4931431C16Rik-201ENSMUST00000124643 2735 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rpa1-202ENSMUST00000092907 5077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmem167b-201ENSMUST00000090546 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Asph-208ENSMUST00000108334 2685 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Npy4r-201ENSMUST00000052164 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms