Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrit3W8DXL4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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