Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms