Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp5Q9Z2P8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms