Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gipc2Q9Z2H7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms