Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RfxankQ9Z205 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms