Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uso1Q9Z1Z0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uso1Q9Z1Z0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Uso1Q9Z1Z0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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