Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms