Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog1Q9Z160 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog1Q9Z160 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms