Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NgfrQ9Z0W1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NgfrQ9Z0W1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms