Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Itsn1Q9Z0R4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itsn1Q9Z0R4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn1Q9Z0R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn1Q9Z0R4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms