Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AireQ9Z0E3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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