Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PapolbQ9WVP6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PapolbQ9WVP6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PapolbQ9WVP6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms