Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IncenpQ9WU62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IncenpQ9WU62 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IncenpQ9WU62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms