Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma1Q9R1P4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma1Q9R1P4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms