Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb3Q9R1P1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms