Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubd1Q9R1K7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubd1Q9R1K7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubd1Q9R1K7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms