Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed2Q9R0Q3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmed2Q9R0Q3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms