Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod2Q9R0B9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms