Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lamc3Q9R0B6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc3Q9R0B6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lamc3Q9R0B6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms