Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc6Q9R087 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gpc6Q9R087 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gpc6Q9R087 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc6Q9R087 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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