Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtsjQ9R014 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsjQ9R014 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms