Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d3cQ9QZS8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms